東吉嶼位於望安島東南方，海拔最高點約47公尺，是澎湖南方四島中面積最大的方山島嶼。其周圍海域就是有名的「黑水溝」，當年先祖輩「唐山過台灣」橫渡黑水溝，就是以東、西吉嶼為明顯地標，是先民渡台的重要前哨站。
海洋國家公園管理處（以下簡稱「海管處」）管轄的澎湖南方四島國家公園，位於澎湖縣南方海域東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼及其周邊島嶼，擁有壯闊的玄武岩地質景觀、富饒的珊瑚礁生態與獨特的歷史人文地景，不過現地旅遊發展因受限於交通因素，目前多以小團體包船或舉辦生態體驗營等方式推廣該地區旅遊活動，每批次人數多限制在一艘遊艇之搭載量，約20-45人左右。
依遊憩據點之特色，園區內遊憩資源可歸納為海域休閒體驗及陸域景觀導覽兩類休閒活動類型：
（一）海域休閒體驗型：園區內海域資源豐富且具有獨特性，除海岸潮間帶觀察活動外，各島周圍海域中之珊瑚群聚所形成的大面積珊瑚礁景觀是進行浮潛與潛水等休閒活動的良好地點，是結合海域休閒體驗活動與海洋環境教育的重要基地。
（二）陸域景觀導覽型：區域內陸域遊憩資源多樣，包括各種玄武岩地質景觀、人文聚落景觀與鳥類觀察等活動，適合的遊憩行程豐富，自然生態與人文景觀兼具，可讓遊客在相關活動中瞭解澎湖的玄武岩地質特色，欣賞以鷗科為主的鳥類生態，也可透過聚落導覽行程，體驗南方四島的人文風情與歷史發展。
澎湖南方四島國家公園在東吉嶼的標示碑
目前提供相關遊憩資訊、服務遊客及協助緊急救護事宜的遊客中心設在東吉嶼及東嶼坪嶼，另於馬公市設有服務中心。囿於強勁東北季風影響，適合到澎湖南方四島國家公園旅遊的時間只在春末到秋初時間，並集中在夏季（尤其暑假）。目前年度最多旅遊人數的統計是2010年東吉嶼登島人數共69,523人、2011年東嶼坪嶼登島人數共11,904人。
海管處為提供澎湖南方四島國家公園內環境教育、生態旅遊所需之用水，及避免超抽地下水並涵養水資源，加之協助地方政府改善東吉嶼及東嶼坪嶼島上飲用水品質，於2017年在這二小島各建置1座海水淡化廠（以下簡稱「海淡廠」）， 經過一年試運轉，於2018年正式營運，造福到訪的遊客與在地居民。
海洋國家公園管理處在東吉嶼建置的海水淡化廠
另考量聚落既有井水儲水塔及供水管線老舊，為使用水品質提升，於同年新設供水系統（含水表）至各家戶（東吉54戶、東嶼坪32戶），目前免費提供海淡水。這是這二島在劃入國家公園範圍後，在地居民得到長期來縣政府無法照顧到的實質生活福利。
後因離島地處偏遠及環境因子（如潮濕與鹽分）對機械設備損耗影響甚大，設備如遇故障待修，將無法造水而影響水資源使用分配，海管處再於2022年於兩島各增設1組海水淡化機組，以便輪替運作及緊急備用。
底下是海淡廠運作的一些參考數據，由海管處提供：
海淡機組造水量能（以每日24小時運轉計算）：
原機組：生活用水20噸（0.8噸/時）；飲用水2噸（0.08噸/時）
備用機組：生活用水20噸（0.8噸/時）
儲水及其他設施：
東吉嶼：100噸儲水塔×1、生飲台×1、發電機組×2、慢濾池×1、鹵水池×1、取水、給水系統×1
東嶼坪嶼：50噸儲水塔×1、生飲台×1、發電機組×2、慢濾池×1、鹵水池×1、取水、給水系統×1
東吉嶼100噸海淡水儲水塔
現階段四島之旅遊型態大多還是以一日跳島行程為主，上島遊客量雖多，惟停留時間僅有1~3小時不等，海管處提供2021年9月-2022年9月實際用水量統計如下：
• 東吉嶼用水量統計：2,141噸/年（平均約5.9噸/日）
含遊客服務中心、公廁、生飲台、村落及機關
• 東嶼坪嶼用水量統計：4,554噸/年（平均約12.5噸/日）
含遊客服務中心、公廁、生飲台、村落及機關
海水淡化後，供給到東吉嶼及東嶼坪嶼的家戶口，這兩地居民真有福氣。
現地操作管理：
• 為確保海淡廠正常運轉，兩廠各1名人員負責操作造水、給水系統，並由專業人員每月進行設備維護及耗材更換等保養維修工作。
• 造水頻度：每日造水4至24小時，以儲水塔維持滿水位為原則。
• 東吉嶼給水時段：參考鄉公所管理之公井每周二及周六給水，目前固定每周四給水2小時。
• 東嶼坪嶼給水時段：每日上午2小時、下午2小時給水。
建造成本：
• 海淡廠建置3,383萬（東吉1,753萬、東嶼坪1,630萬）
• 給水系統設置727萬（東吉446萬、東嶼坪281萬)
• 新增海淡備用機組719萬（東吉363萬、東嶼坪356萬）
每年維護成本（東吉、東嶼坪合計）
• 海淡廠操作與維護費用約250萬/年
• 耗材費用約70萬/年
• 電費約12萬元/年（註：海淡廠原先電力系統來自廠內自有柴油發電機組，以進行造水作業，直到2010年中才改由鄉公所營運的社區發電機廠供電，並完成電錶裝設，才能明確估計電費。）
以2011年兩座海淡廠造水量與其維護營運成本為例，粗估每噸海淡水造水成本：
(250萬+70萬+12萬)/(2,141噸+4,554噸)= 496元/噸，也就是說在東吉嶼及東嶼坪嶼一度水的費用至少是496元。
（臺灣自來水公司的水費顯然便宜太多了，每度費用由第一段的7.35元到第四段的12.075元，台北市自來水費級距則為第一段的5元到第五段的20元。）
資料來源：臺灣自來水公司
造水成本為粗略計算，計算式所採用的成本是浮動的（且沒包含建置成本分攤），另外，造水量取樣區段僅有1年，數據樣本過低，計算結果僅可表示離島造水成本非常高，希望到島上旅遊的遊客或居住期間的居民都善用、節用這得來不易、彌足珍貴的淡水資源。
望安鄉東吉村聚落與東吉碼頭，海水淡化廠在東吉碼頭附近。
以下是東吉嶼部分風光：
看海的羊群
往來馬公港與東吉嶼的遊艇
東吉村的信仰中心—啟明宮（主祀王爺）
遊客中心也是環境教育中心
南方四島上的建築群以東吉嶼最為特殊，除具有以當地硓咕石、玄武岩為建築材料的傳統合院建築外，還有因漁業興盛而富裕的居民，將傳統民居改建為洋樓，形成當地建築特色。
聚落內屋子的咾咕石牆面，有著歲月滄桑之美。
聚落內屋子的咾咕石牆面，有著歲月滄桑之美。
海管處為維護活化澎湖南方四島傳統建築，推動傳統聚落風貌之改善，2022年8月進行「東吉嶼許宅-東吉國小許振坤校長故居」整建維護工程，以守護澎湖南方四島的傳統建築。
東吉燈塔營舍
從海上看東吉燈塔
海管處東吉管理站同仁在廢棄工寮彩繪東吉燈塔，成了打卡點。
東吉氣象站測候儀器
澎湖南方四島國家公園的陸海域面積共35843.62公頃，其中海域面積佔99％。海域管理比陸域管理難上加難，海面狀況比陸域複雜更多，從水面上也看不到水下情形，加上交通、氣候、海流等因素，在海洋國家公園工作的人員真是備極辛勞。
每次（其實目前也就二次）到東吉嶼都萬分感動，海洋國家公園管理處東吉管理站只有5名職員、1名聘用人員（另外有委外2名解說行政人員，3名船長，3名巡查員），這麼少的人力要處理生態保育、調查研究、行政業務、社區溝通協調、遊客服務與管理、安全管控、設施建置與維護、緊急事故處理（如貨輪擱淺），尤其還要收拾清運撿不完的海飄垃圾……，真是讚嘆東吉管理站人員都是三頭六臂，而且任勞任怨，這些基層的公務員及工作人員對國家的貢獻令我敬佩。
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